La journée se déroule de 10 à 20 heures à l’Université Paris Diderot, dans le bâtiment de la Halle aux Farines (esplanade Pierre Vidal-Naquet), en salle 027C (rez-de-chaussée).
Accès
Inscription gratuite et obligatoire avant le 25 octobre à partir de la page des journées du GDR.
Programme prévisionnel
Matin
- 10h00-10h15, Introduction de la matinée
- 10h15-10h40, Perrine Soret, retour d’expériences sur le clustering sur de données RNASeq, [PPTX]
- 10h40-11h00, Luc Jouneau, présentation de la procédure de tests multiples ‘Independent hypothesis weighting (IHW)’, [PDF]
- 11h00-11h30, Marine Gauthier, ‘Conditional cumulative distribution function estimation for differential gene expression analysis in single-cell RNA-seq data’, [PDF]
- 11h30-12h00, Julie Aubert, présentation des ressources mises à disposition par le groupe StateoftheR, [PDF]
- 12h00-12h15, Laurent Duval, An epigenetic data processing bud @ StatOmique ? A novel collaborative subnetwork, [PDF]
Pause déjeuner
Après-midi
- 14h–14h15, Introduction à l’après-midi
- 14h15–15h15, Federico Marini, package Bioconductor iSEE(Interactive Summarized Experiment Explorer), [github]
- 15h15-15h45, Cécile Chauvel, Evaluation of integrative clustering methods for the analysis of multi-omics data, (https://doi.org/10.1093/bib/bbz015), [PDF]
Pause
- 16h15-16h45, Silvia Bottini, Clinical setting specific semi-supervised approach to model synthetic genomes of pregnant women to determine confidence intervals for NIPT, [PPTX]
- 16h45-17h15 Mickael Guedj, Méthodes de repositionnement de médicaments à partir des big data biomédicales, [PPTX]
Rétrospective : 10 ans de StatOmique (17h15-17h45), [PDF]
Apéritif accompagné d’une session poster