Présentation

Nantes, l’éléphant des machines de l’île lors des « Rencontres du fleuve ». © Patrick Garçon – Nantes Métropole

Le workshop pluridisciplinaire SeqBio 2016 se tiendra à Nantes les 17 et 18 novembre 2016.

Il réunit les communautés de l’informatique et de la bioinformatique travaillant sur les méthodes d’analyses des textes et les biologistes et génomiciens intéressés par la bioinformatique de séquences.

 

Reflet de la tour LU Lieu Unique équipement culturel © Régis Routier | Ville de Nantes
Reflet de la tour LU Lieu Unique équipement culturel. © Régis Routier | Ville de Nantes

Il est soutenu financièrement par les Groupement de Recherches BIM et IM du CNRS, le projet régional GRIOTE, la Fédération de Recherche AtlanSTIC, ainsi que le LINA et l’Université de Nantes qui accueillent cette édition 2016. La participation est entièrement gratuite mais pour des raisons d’organisation, il est obligatoire de s’inscrire aux journées.

Le programme comprend des exposés sélectionnés sur soumission et des exposés invités.

Les thèmes abordés à SeqBio vont de la combinatoire et de l’algorithmique du texte à leurs applications à l’analyse bioinformatique des séquences biologiques. Cela inclut notamment les sujets suivants :

  • algorithmique du texte,
  • structures d’indexation,
  • combinatoire et statistiques des mots,
  • algorithmique haute performance ou parallèle,
  • fouille de textes,
  • compression,
  • alignement et recherche de similarité,
  • recherche, découverte et inférence de motifs ou de répétitions,
  • analyse des données de séquençage haut-débit (génomique, RNA-seq, ChIP-seq, …),
  • annotation des génomes, prédiction de gènes,
  • haplotypes et polymorphismes,
  • génomique comparative.

Précédentes éditions :