Le Workshop pluridisciplinaire SeqBio 2013 se déroulera au Campus CNRS de Montpellier les 25 & 26 novembre 2013.
Il réunit les communautés d’informatique et de bioinformatique travaillant sur les méthodes d’analyses des textes et les biologistes, génomiciens intéressés par la bioinformatique de séquences.
Grâce au financement des GdR BIM et IM et du projet MASTODONS SePhHaDe, la participation est entièrement gratuite.
Le programme comprend des exposés sélectionnés sur soumission et des exposés invités.
La compilation des résumés est disponible au téléchargement.
Les thèmes abordés à SeqBio vont de la combinatoire et de l’algorithmique du texte à leurs applications à l’analyse bio-informatique des séquences biologiques. Cela inclut les sujets suivants, sans y être limité :
- algorithmique du texte
- structures d’indexation
- combinatoire et statistiques des mots
- algorithmique haute performance ou parallèle
- fouille de textes
- compression
- alignement et recherche de similarité
- recherche, découverte et inférence de motifs ou de répétitions
- analyse des données de séquençage haut-débit (génomique, RNA-seq, Chip-seq, …)
- annotation des génomes, prédiction de gènes
- haplotypes et polymorphismes
- génomique comparative
- signaux de régulation
Les exposés seront organisés par session avec des sensibilités plus informatique, mathématique, ou bio-informatique.