Journée StatOmique – 5 novembre 2019

La journée se déroule de 10 à 20 heures à l’Université Paris Diderot, dans le bâtiment de la Halle aux Farines (esplanade Pierre Vidal-Naquet), en salle 027C (rez-de-chaussée).

Accès

Inscription gratuite et obligatoire avant le 25 octobre à partir de la page des journées du GDR.

Programme  prévisionnel

Matin

  • 10h00-10h15, Introduction de la matinée
  • 10h15-10h40, Perrine Soret, retour d’expériences sur le clustering sur de données RNASeq
  • 10h40-11h00, Luc Jouneau, présentation de la procédure de tests multiples ‘Independent hypothesis weighting (IHW)’
  • 11h00-11h30, Marine Gauthier, ‘Conditional cumulative distribution function estimation for differential gene expression analysis in single-cell RNA-seq data’
  • 11h30-12h00, Julie Aubert, présentation des ressources mises à disposition par le groupe StateoftheR (https://stateofther.github.io/)

Pause déjeuner

Après-midi

  • 14h–14h15, Introduction à l’après-midi
  • 14h15–15h15, Federico Marini, package Bioconductor iSEE(Interactive Summarized Experiment Explorer)
  • 15h15-15h45, Cécile Chauvel, Evaluation of integrative clustering methods for the analysis of multi-omics data, (https://doi.org/10.1093/bib/bbz015)

Pause

  • 16h15-16h45, David Pratella, Clinical setting specific semi-supervised approach to model synthetic genomes of pregnant women to determine confidence intervals for NIPT
  • 16h45-17h15 Mickael Guedj, Méthodes de repositionnement de médicaments à partir des big data biomédicales

Rétrospective : 10 ans de StatOmique (17h15-17h45)

Apéritif accompagné d’une session poster